全自動配液系統整個配液系統的配液、CIP清洗、SIP消毒，通過PLC控制程序自動進行，并且通過設置的打印機，打印出一些參數；通過對參數分析，判斷配液系統配液是否正確、CIP清洗 、SIP消毒是否合格，從而確定整個配液系統是否無菌與安全。

    配液罐底部安裝了一個電導率儀，以電導率值，來確定罐與管道清洗程度；若用純化水洗，則清洗程度以純化水電導率范圍為準；若用蒸餾水洗，則清洗程度以蒸餾水電導率范圍為準；管 道清洗過程中，也需電導率儀的控制，在清洗過程中，觀察管路上電導率顯示值，對照蒸餾水、純化水的電導率范圍，分析管道清洗的程度即可。

    全自動配液系統在進行消毒過程中，需要考慮滅菌消毒溫度，所以每臺罐底部安裝一個不銹鋼表盤溫度計，根據溫度計顯示值，來確定罐與管道消毒時的溫度；滅菌消毒所用的飽和蒸 汽溫度為121℃，且在該溫度下持續消毒30分鐘，此過程中純蒸汽轉變成冷凝水，通過罐底氣動隔膜閥、管道上氣動隔膜閥與氣動衛生球閥，將冷凝水排掉。

    為了保證為細胞生長和代謝提供合適的溫度，溫度控制系統也是通氣攪拌罐所*的，溫度控制系統由溫度測量電極、熱交換裝置及相應的控制裝置組成。由于生物反應和機械攪拌都是放熱過程，多數生物反應體系在運行期間需要冷卻，就地滅菌后的培養基更要求快速泠卻。全自動配液系統通常采用罐內安裝的冷卻盤管或采用夾套式發酵罐進行溫度控制；而對5m3以下的小型通氣攪拌罐，熱交換器多采用夾套作為換熱裝置。

    對大型反應器，盤管的冷卻效率要遠高于夾套，而且傳熱面積可以根據需要設計，但它要占用反應器空間，并使反應器清洗和滅菌更加困難。為了強化傳熱，夾套可以設計成蜂窩狀以增加 冷卻介質的流速，這樣可以彌補傳熱面積不足的限制。